一五四九年就开始在日本传教。另外，葡萄牙和荷兰也不希望西班牙参与对日贸易。

拐点在于一六零九年，万历三十七年，西班牙大型帆船圣弗朗西斯科号在从马尼拉至阿卡普尔科的途中遭遇恶劣天气而在江户附近的千叶失事。船员们被救起并受到热情款待，船长受到了德川家康的接见。

当年十一月二十九，双方签订了一个条约。条约中约定西班牙人得以在日本东部建立工厂，并从新西班牙引进采矿专家，西班牙商船在必要时允许拜访日本，而日本方面将会派遣一位使者出使西班牙王室。

最初的日本使者是在江户传教的方济各教会修士索铁罗，他代表幕府将军前往新西班牙（墨西哥），见到了总督维拉科。新西班牙总督又派遣了探险家前往日本，并且寻找传说中的“金银岛”。

这位探险家的外交工作并不顺利，而且在寻找金银岛途中因为海难而带着重伤回到日本。于是德川幕府决定建造一艘大船，将这位探险家送回西班牙。

这个任务落在了仙台藩大名伊达政宗的头上，伊达政宗又命令家臣支仓常长主领此任务。

支仓常长用了四十五天的时间，以幕府提供的八百名造船工匠，七百名铁匠，三千名木匠，完成了日本人称作“伊达村丸”远洋大帆船。这艘船后由西班牙人改名为圣胡安?包蒂斯塔号，完成远航任务之后被吕宋的西班牙军队征召，用以对抗荷兰人。

支仓常长带了十名幕府武士、十二名仙台武士、一百二十名日本商人、船员和随从，以及四十余名西班牙人与葡萄牙人，开始了亚洲人首次横跨太平洋的旅途。三个月后，他平安到达了新西班牙，随后前往欧洲，出使了西班牙王室，甚至前往罗马觐见了教皇，并且受洗。

支仓常长出发时，德川幕府还没有发布锁国令，但是等他再次通过太平洋航线回到日本的时候，日本已经彻底变样了。至于他最终是被处